Los representantes de los equipos de la Liga Nacional decidieron mantener el formato de competencia para la temporada 2024-2025, a pesar de haber acordado previamente modificarlo para que solo seis equipos avanzaran a la fase final.
En la asamblea ordinaria de la Liga Nacional, , Achuapa propuso reabrir la discusión sobre el formato. Participaron los 10 equipos acreditados, aunque los ascendidos de la Liga Primera División (Marquense y el ganador entre Juventud Pinulteca y Juventud Copalera) aún no están acreditados.
Comunicaciones , Municipal, Antigua GFC y Xelajú MC apoyaron la propuesta de reducir a seis el número de equipos que clasifican a la fase final, pero la votación terminó 4-6 en contra.
Así, se disputarán tres rondas durante la fase de clasificación: intergrupos, partidos contra los equipos del mismo grupo, y nuevamente intergrupos para los juegos de vuelta. La fase final contará con cuartos de final, semifinales y final, sin más cambios en el formato.