La Asamblea General Extraordinaria de la Liga Nacional determinó el descenso de Zacapa y varias modificaciones en el inicio del Torneo Clausura 2025, formato de competencia, y criterios de desempate para la fase final (cuartos y semifinales), asimismo, la calendarización de partidos.
Una de las principales decisiones de la Asamblea General Extraordinaria fue oficializar el descenso del Zacapa, quien no atendió los llamados por la Liga y por ende se decidió que ya no formara parte del Clausura 2025. De esta forma, el conjunto oriental es el primer descendido de la temporada 2024-2025. En este Clausura 2025 solamente habrá un equipo que descienda.
Zacapa nunca se pronunció sobre si tenía o no la capacidad económica para encarar el Clausura 2025, ante ello, se consultó ante la Fedefut sobre los equipos que cuentan con la solvencia económica, pero nunca hubo respuesta.