Los dos últimos títulos del equipo «Escarlata» llevan la firma del estratega argentino. Después del hexacampeonato de Comunicaciones entre el Apertura 2012 y el Clausura 2015, una era de frustración se instauró en Municipal. Desde entonces, el equipo ha conseguido solo tres títulos: Clausura 2017, Apertura 2019 y Clausura 2024.
Estos campeonatos tienen un marcado sello sudamericano gracias a sus técnicos. El uruguayo Gustavo Machaín lideró al equipo al título del Clausura 2017, mientras que el argentino Sebastián Bini ha sido responsable de los triunfos en el Apertura 2019 y Clausura 2024.
Tras una sequía de dos años y siete meses, Sebastián Bini devolvió la gloria a Municipal en el Apertura 2019, cuando vencieron a Antigua GFC con un global de 3-2. El partido de ida terminó 0-1 y el emocionante empate 2-2 en la vuelta, en el Estadio Nacional Doroteo Guamuch Flores, aseguró el título.
Buscando el bicampeonato, el Clausura 2020 fue declarado desierto debido a la pandemia de COVID-19. En el Apertura 2020, Municipal defendió el título pero cayó en la final ante Deportivo Guastatoya en el Estadio Manuel Felipe Carrera. En el Clausura 2021, fueron eliminados por Deportivo Iztapa, a pesar de que el equipo rival tenía nueve bajas por contagio de coronavirus, incluido el goleador Carlos Kamiani Félix.
Tras estas decepciones, la junta directiva destituyó a Sebastián Bini en mayo de 2021. El argentino se fue con el sabor amargo de no lograr el bicampeonato y tras una dolorosa eliminación ante Deportivo Saprissa en la Liga Concacaf 2020, además de acumular cinco clásicos sin victoria.
El Regreso de Sebastián Bini
Sebastián Bini se fue al fútbol salvadoreño para dirigir al Águila de San Miguel, donde logró llevar al equipo a la cima de la fase regular del Clausura 2023. Sin embargo, la tragedia en el Estadio Cuscatlán, con una estampida que dejó al menos 12 muertos, llevó a la cancelación del campeonato, impidiendo que Bini demostrara el verdadero potencial del Águila.
El 29 de mayo de 2023, Municipal anunció el regreso de Bini. Su misión era clara: dar oportunidades a los jóvenes, respaldar a Kenderson Navarro y devolver a Municipal al título.
En este nuevo ciclo, Jonathan Franco se consolidó como titular antes y después del Mundial Sub-20 de Argentina. Aunque Bini enfrentó críticas por su apoyo a Kenderson Navarro, finalmente se decidió traer a un arquero más experimentado, el argentino Alejandro Medina, aunque también fue cuestionado por la afición.
El tercer objetivo, el más importante, lo alcanzó en el Clausura 2024. En el Apertura 2023, Municipal fue eliminado por Deportivo Zacapa en los cuartos de final, perdiendo ambos partidos. Aquel día, Bini tuvo un enfrentamiento verbal con una parte de la afición roja, generando más tensión.
A pesar de estos desafíos, Bini logró llevar a Municipal al título del Clausura 2024, consolidando su legado y sumando otro trofeo a la historia del club.