Cobán Imperial ha disputado 7 finales en la Liga Nacional de Guatemala. De esas finales, ha logrado consagrarse campeón en 2 ocasiones y ha sido subcampeón en 4 oportunidades.
Finales disputadas:
- 1979 – Subcampeón. Participó en una triangular extra contra Municipal y Comunicaciones para definir al campeón, pero no logró el título.
- 1997-1998 – Subcampeón. Terminó en segundo lugar en la clasificación y fue tercero en la hexagonal final, lo que le valió el subcampeonato.
- Apertura 2001 – Subcampeón. Perdió la final en penales contra Municipal.
- Clausura 2003 – Subcampeón. Fue derrotado por Comunicaciones con un gol de oro en el partido de vuelta.
- Clausura 2004 – Campeón. Cobán Imperial ganó su primer título de Liga tras vencer a Municipal con un gol de oro de Tránsito Montepeque.
- Apertura 2022 – Campeón. Se consagró campeón tras vencer a Antigua GFC por un global de 1-0.
- Apertura 2024 – Actualmente, está disputando la final contra Xelajú MC, buscando su tercer título de Liga.
En total, Cobán Imperial ha sido campeón 2 veces (2004 y 2022) y ha obtenido 4 subcampeonatos (1979, 1997-98, 2001, 2003). La actual final (Apertura 2024) será su séptima participación en finales de la Liga Nacional
