En los inicios de los Torneos Cortos Municipal se caracterizó por sostener a sus entrenadores por largos períodos. El primero que realizó una gran cantidad de partidos fue el argentino Horacio Cordero que condujo al equipo en 82 partidos en cuatro torneos consecutivos. Cordero cumplió una segunda fase en donde sumó 28 juegos más.
Posteriormente llegó al banco escarlata el paraguayo Ever Hugo Almeida que se mantuvo en el cuadro edil por cuatro años y 142 juegos. Su remplazante fue otro argentino: Enzo Trossero que llegó a dirigir a los rojos en 122 ocasiones.
El resto de entrenadores ya no consiguieron mantenerse en el banco del equipo de la capital en muchos partidos con la excepción de Carlos Ruiz y Javier Delagdo con 42 y 56 partidos, respectivamente.
Otros técnicos como Jorge Benítez, Jorge Habbeger, Manuel Keossián o el mismo Mardiaga no superaron los 25 partidos al frente de la institución.
El nuevo entrenador está en negociaciones con los capitalinos.
